سازمان بهداشت جهانی آذربایجان و تاجیکستان را به عنوان عاری از مالاریا تایید کرده است

تلاش‌های کنترل مالاریا در آذربایجان و تاجیکستان از طریق طیف وسیعی از سرمایه‌گذاری‌ها و سیاست‌های بهداشت عمومی که دولت‌ها را در طول زمان قادر ساختند تا این بیماری را از بین ببرند و وضعیت عاری از مالاریا را حفظ کنند، تقویت شد.
برای بیش از شش دهه، هر دو دولت مراقبت های بهداشتی اولیه جهانی را تضمین کرده اند.آنها به شدت از مداخلات هدفمند مالاریا حمایت کرده‌اند - از جمله، برای مثال، اقدامات پیشگیرانه مانند سمپاشی دیوارهای داخلی خانه‌ها با حشره‌کش‌ها، ترویج تشخیص و درمان زودهنگام همه موارد، و حفظ مهارت‌ها و ظرفیت‌های همه کارکنان بهداشتی درگیر در از بین بردن مالاریا.

هم جمهوری آذربایجان و هم تاجیکستان از سیستم‌های ملی نظارت الکترونیکی مالاریا استفاده می‌کنند که تقریباً در زمان واقعی موارد را تشخیص می‌دهد و امکان بررسی‌های سریع را برای تعیین محلی بودن یا وارداتی بودن عفونت فراهم می‌کند.مداخلات اضافی شامل روش‌های بیولوژیکی کنترل لارو، مانند ماهی‌های پشه‌خوار، و اقدامات مدیریت آب برای کاهش ناقلان مالاریا است.
از دهه 1920، بخش قابل توجهی از اقتصاد تاجیکستان و تا حدی آذربایجان، به تولیدات کشاورزی، به ویژه صادرات با ارزش پنبه و برنج وابسته است.

سیستم های آبیاری کشاورزی در هر دو کشور از لحاظ تاریخی نیز خطر مالاریا را برای کارگران به همراه داشته است.هر دو کشور سیستم هایی را برای محافظت از کارگران کشاورزی با ارائه دسترسی رایگان به تشخیص و درمان مالاریا در سیستم مراقبت های بهداشتی عمومی ایجاد کرده اند.
کارکنان کنترل مالاریا این ظرفیت را دارند که بلافاصله کارگران آلوده را با داروهای ضد مالاریا مناسب آزمایش، تشخیص و درمان کنند و عوامل خطر محیطی، حشره‌شناختی و اپیدمیولوژیک را پایش و ارزیابی کنند.فعالیت های برنامه اضافی شامل ارزیابی منظم استفاده عاقلانه از حشره کش ها برای کنترل ناقلین، اجرای سیستم های مدیریت آب، و آموزش عمومی در مورد پیشگیری از مالاریا است.